Для идентификации различных бактерий используются биохимические тесты.
Индол тест
Анализируемые организмы инокулируют в триптоновую питательную среду, богатый источник аминокислоты триптофана. Индол позитивные бактерии, например, Escherichia coli выделяют триптофаназу, фермент, расщепляющий трптофан, при этом продуцируя индол и другие продукты. Когда в питательную среду с индолом вносится реактив Ковача (пара-диметиламинобензальдегид), раствор становится фиолетового цвета. Индол тест должен поводиться в течение 48 часов инкубации, потому что индол подвергается дальнейшему разрушению. Кислая среда, создаваемая Escherichia coli, ограничивает развитие палочки.

