Нитрит (NO₂) является токсином, который продуцируется бактериями во время гниения органической материи в процессе нитрификации. В высоких концентрациях приводит к гибели рыбок.

Бактерии Nitrosomonas, находящиеся в фильтре, окисляют смертельно опасный аммиак (NH₄), образованный в результате разложения органики и выделяющийся у рыбок, до нитрита, который менее токсичен для обитателей аквариума. Другие бактерии, Nitrospira и Nitrobacter, переводят нитрит в нитрат (NO₃), слегка токсичный по сравнению с двумя предыдущими. При содержании аквариумных рыбок очень важно проводить диагностику содержания аммиака, нитритов и нитратов.