Понятие пробиотик в основном используется в отношении бактерий, которые способны укреплять здоровье других организмов. Лиллей и Стиллвелл (Lilley and Stillwell, 1965) описали вещества, секретируемые микроорганизмами, которые стимулировали развитие хозяина. Таким образом, пробиотиками называют живые микроорганизмы, потребление которых в адекватных количествах благотворно сказывается на здоровье хозяина (FAO/WHO, 2001).

Пробиотические штаммы выделяются из врожденной или экзогенной микрофлоры водных животных. Грамотрицательные факультативные бактерии, такие как Vibrio и Pseudomonas составляют значительную часть микрофлоры морских видов рыб (Onarheim et al., 1994). В свою очередь, микрофлора пресноводных видов рыб представлена родами Aeromonas, Plesiomonas, семействами Enterobacteriaceae и облигатными анаэробными бактериями рода Bacteroides, Fusubacterium и Eubacterium (Sakata, 1990). Молочнокислые бактерии, доминирующие в кишечнике млекопитающих или птиц (Bifidobacterium у человека, Lactobacillus у свиней, кроликов и птиц, Enterococcus у насекомоядных), обычно в незначительной степени представлены у рыб родом Carnobacterium (Ringø and Vadstein, 1998).