Системы с биофлоком разработаны для улучшения экологического контроля над производством­. В районах с недостатком воды или дорогой землей рентабельное производство требует более интенсивных методов ведения аквакультуры. По многим экономическим причинам, с учетом дорогих кормов и ограниченных площадей и воды, биофлок технология демонстрирует свою эффективность. Выращивание рыбы в условиях высокой плотности посадки, как правило, требует определенной инфраструктуры для обработки отходов. По своей сути, биофлок технология представляет собой механизм очистки отходов.