
Система рециркуляцией в цветущей воде строится на круговороте и вторичном использовании органического вещества. Продукты жизнедеятельности рыбы состоят из компонентов, очень легко поддающихся биораспаду, а также растворенных соединений азота и примесей фосфора, выделяющегося из экскрементов и разлагающихся остатков кормов. Процесс переработки происходит естественным путем с помощью бактерий и водорослей, которые обитают в больших количествах резервуарах и земляных водоемах (отсюда термин «цветущая вода»). Они участвуют в процессе гетеротрофного разложения органических отходов, сопровождающегося окислением аммиака до нитритов и нитратов путем нитрификации и денитрификации. Окисление происходит при участии определенных групп бактерий (Nitrosomonas sp. и Nitrobacter sp.).